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17: Diversidad del paisaje - Biología

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Un paisaje es "un mosaico de formas heterogéneas de la tierra, tipos de vegetación y usos de la tierra" (Urban et al., 1987). Por lo tanto, conjuntos de diferentes ecosistemas (los entornos físicos y las especies que los habitan, incluidos los humanos) crean paisajes en la Tierra. Aunque no existe una definición estándar del tamaño de un paisaje, por lo general se encuentran en los cientos o miles de millas cuadradas.

La composición de las especies y la viabilidad de la población a menudo se ven afectadas por la estructura del paisaje; por ejemplo, el tamaño, la forma y la conectividad de parches individuales de ecosistemas dentro del paisaje (Noss, 1990). El manejo de la conservación debe estar dirigido a paisajes completos para asegurar la supervivencia de especies que se distribuyen ampliamente en diferentes ecosistemas (por ejemplo, jaguares, quetzales, especies de plantas que tienen polen y semillas ampliamente dispersos) (Hunter, 2002: 83-85, 268-270).

La diversidad dentro y entre paisajes depende de las variaciones locales y regionales de las condiciones ambientales, así como de las especies sustentadas por esos ambientes. La diversidad del paisaje se incorpora a menudo en las descripciones de "ecorregiones",

Glosario

Paisaje
un mosaico de formas de tierra heterogéneas, tipos de vegetación y usos de la tierra (Urban et al., 1987)

El panorama del editoma de ARN A-to-I de 462 genomas humanos

La edición A-to-I, como un proceso de modificación postranscripcional mediado por ADAR, juega un papel crucial en muchos procesos biológicos en los metazoos. Sin embargo, se desconoce en gran medida cómo y en qué medida la edición A-to-I se diversifica y da forma a la diversidad de la población a nivel de ARN. Aquí, usamos 462 muestras de secuenciación de ARNm de cinco poblaciones del Proyecto Geuvadis e identificamos 16,518 sitios de edición A-to-I, con una tasa de detección falsa del 1.03%. Estos sitios forman el paisaje del editoma de ARN del genoma humano. Al explorar la edición de ARN dentro y entre poblaciones, revelamos la restricción geográfica de los sitios de edición raros y los patrones específicos de la población de los sitios de edición de edQTL. Además, mostramos que la edición de ARN se puede utilizar para caracterizar la diversidad sutil pero sustancial entre diferentes poblaciones, especialmente las de diferentes continentes. Tomados en conjunto, nuestros resultados demostraron que la naturaleza y la estructura de las poblaciones a nivel de ARN se ilustran bien mediante la edición de ARN, que proporciona información sobre el proceso de cómo la edición A-to-I da forma a la diversidad de poblaciones a nivel transcriptómico. Nuestro trabajo facilitará la comprensión del panorama del editoma de ARN a escala poblacional y será útil para interpretar las diferencias en la distribución y prevalencia de enfermedades entre individuos y entre poblaciones.

Declaracion de conflicto de interes

Los autores declaran no tener conflictos de intereses.

Cifras

Caracterización de sitios de edición de ARN ...

Caracterización de sitios de edición de ARN en cinco poblaciones. ( A ) Preferencias de secuencia ...

Paisaje del editoma de ARN…

Paisaje del editoma de ARN en genomas humanos. Sitios de edición de ARN identificados dentro de ...

Sitios de edición de ARN compartidos dentro de ...

Sitios de edición de ARN compartidos dentro y entre poblaciones. ( A ) Fracción de…

Cis- y trans-edQTL en poblaciones.…

Cis- y trans-edQTL en poblaciones. ( A ) FDR para cada edición A-to-I ...

Motivos estructurales de la edición edQTL ...

Motivos estructurales de sitios de edición de edQTL entre poblaciones. ( A ) Mapas de calor que muestran…


Los estudiosos de biología diversifican el panorama de las escuelas de posgrado


Al venir a Cornell de una escuela secundaria de Oklahoma con recursos limitados y una tasa de deserción significativa, Emily Frech ’17 se sintió un poco intimidada al sentarse junto a sus compañeros de primer año de biología de Cornell, algunos de los cuales fueron a escuelas secundarias de élite que atienden a estudiantes de pre-medicina.

Si bien Frech estaba en la cima de su juego académicamente, "sentí que no pertenecía del todo aquí", dijo.

Al comienzo de su primer año, se postuló para el Programa de Becarios de Biología (BSP) de la Oficina de Biología de Pregrado, que ofrece tutoría, grupos de estudio y orientación a estudiantes de biología de grupos subrepresentados.

Frech dijo que el programa la ayudó a lidiar con una B y C ocasional, calificaciones que no había recibido en la escuela secundaria.

“Aprendí que aquí eres un pez pequeño en un gran estanque”, dijo. También aprendió a equilibrar su trabajo con otras actividades para ella, es la Big Red Marching Band, donde lidera la línea de batería. Y BSP la conectó con profesores en su área de interés de nutrición humana, lo que le permitió unirse a un laboratorio de primer año.

BSP, que comenzó en 2006, acepta alrededor de 35 estudiantes de primer año cada año. De los 120 becarios de biología graduados de 2010 a 2016, el 91 por ciento de los que solicitaron ingresar a la escuela de medicina han sido admitidos, 19 están en doctorado. programas y tres están inscritos en M.D./Ph.D. programas.

“El éxito del Programa de Becarios en Biología se debe en gran parte al arduo trabajo y la dedicación de los propios estudiantes”, dijo Jeff McCaffrey, director asistente de asesoría en la Oficina de Biología de Pregrado y coordinador del programa. “BSP proporciona un marco dentro del cual los miembros pueden mejorar y sobresalir académicamente, contribuir al éxito y bienestar de sus pares y participar en su comunidad científica. También tenemos profesores de biología que se ofrecen como voluntarios cada semestre para compartir su experiencia, historias profesionales y tiempo para ayudar a los académicos de biología a comprender los matices de la investigación científica ”.

El programa ayuda a abordar la falta de diversidad en las escuelas de medicina, los programas de posgrado y otros campos de la biología. Esta falta de diversidad afecta no solo la forma en que se gastan los dólares de la investigación, sino que también conduce a una atención desigual para los pacientes, dijo McCaffrey.


Si bien las minorías subrepresentadas comprenden el 13 por ciento de la población de EE. UU., Solo el 4 por ciento de la fuerza laboral de médicos y solo el 5,3 por ciento de los profesores de las escuelas de medicina de EE. UU. Son minorías subrepresentadas, una cifra que ha cambiado poco durante la última década, según la Asociación de Colegios Médicos de Estados Unidos. (AAMC).

Junto con la diversidad racial y étnica, también hay una falta de diversidad socioeconómica entre los estudiantes de las escuelas de medicina de EE. UU., Y la AAMC informa que los estudiantes de medicina que ingresan desde el quintil de ingresos más bajos nunca han superado el 5.5 por ciento del total de estudiantes nuevos.

Los estudiantes de Cornell pueden postularse para BSP durante el primer semestre de su primer año. Los académicos se asignan a grupos de estudio semanales y comienzan a unirse como una unidad durante una excursión en el Curso Desafío Hoffman. También toman dos seminarios de un crédito para estudiantes de primer y segundo año, donde hablan de todo, desde conectarse con profesores hasta encontrar un laboratorio de investigación y explorar opciones profesionales.

También están invitados a una serie de eventos especiales: cenas para profesores, salidas sociales, eventos de redes de exalumnos, visitas a escuelas de medicina / posgrado y oradores invitados.

“A través de BSP, he desarrollado a algunos de mis amigos más cercanos”, dijo Jessica Nino de Rivera ’17, una estudiante de ciencias biológicas que quiere combinar sus intereses en la medicina y las políticas de atención médica. “El programa ha hecho mucho por mí. Como estudiante de primera generación, quiero ayudar a otros que provienen de entornos similares ".

Nino de Rivera ha sido líder de grupo de estudio para cursos de química orgánica y general. “Les digo a los estudiantes de primer año que no se asusten, que si se esfuerzan y hacen preguntas cuando necesitan ayuda, estarán bien”, dijo.

Los académicos de biología desarrollan rápidamente un sentido de pertenencia en Cornell, lo que tiene un impacto positivo en su éxito académico y adaptación social.

"BSP me ayudó a darme cuenta de la importancia de trabajar en grupos", dijo Daniel Veronese ’17, un estudiante de ciencias biológicas con especialización en ecología y biología evolutiva.

Veronese, quien se mudó a los EE. UU. Desde Venezuela cuando tenía 11 años, sabía que quería estudiar biología pero pensó que sus únicas opciones profesionales eran la medicina hasta que fue seleccionado como uno de los 12 académicos en biología para participar en el plan de estudios de Galápagos. Ese plan de estudios es un conjunto de cursos vinculados en la primavera del primer año: una versión intensiva de Introducción a la Biología Evolutiva (ciencias), un seminario temático de escritura para estudiantes de primer año (humanidades) y un seminario de ilustración científica (artes). El plan de estudios incluye un viaje con todos los gastos pagados al archipiélago de Galápagos durante las vacaciones de primavera, dirigido por Irby Lovette, profesora Fuller de ornitología y directora asociada de asuntos académicos en el Laboratorio de Ornitología de Cornell.

Veronese dijo que la experiencia le abrió la mente al trabajo de campo con animales y carreras en investigación. El verano siguiente, hizo trabajo de campo en Australia y se sorprendió "de que pudiera tener una carrera en algo que amaba hacer todos los días".

Hendryck Gellineau ’19 también se relacionó con la investigación al principio de su carrera en Cornell, lo que le ayudó a descubrir el amor por la química (ahora su especialidad).

Después de tomar una clase de química como estudiante de primer año y leer una historia sobre el cobre y cómo podría usarse en productos farmacéuticos, Gellineau se puso en contacto con Justin Wilson, un nuevo miembro de la facultad de química de Cornell que estudiaba complejos metálicos, quien finalmente invitó a Gellineau a unirse a su laboratorio.

"Me hizo reaccionar de muchas maneras diferentes cuando era estudiante de primer año", dijo, por lo que Gellineau se quedó en el laboratorio el verano pasado como parte del programa de Aceleración del Progreso Médico a través de Becas del HHMI de Cornell, mientras también tomaba un curso de química orgánica.

Gellineau cree que podría querer obtener un M.D./Ph.D. centrándose en la química orgánica y puede entrar en el desarrollo de fármacos.

"Creo que donde puedo ser útil es detrás de escena", dijo, "para que los médicos de las salas de emergencia tengan lo que necesitan para ayudar a los pacientes".


Vinculación de la diversidad biológica y lingüística

Un león se relaja en el Parque Nacional Serengeti, Tanzania. Crédito: Larry Gorenflo, Penn State

La diversidad cultural, indicada por la diversidad lingüística, y la biodiversidad están vinculadas, y su conexión puede ser otra forma de preservar tanto los entornos naturales como las poblaciones indígenas en África y quizás en todo el mundo, según un equipo internacional de investigadores.

"La conclusión es que si estás interesado en conservar la diversidad biológica, excluir a los pueblos indígenas que probablemente ayudaron a crear esa diversidad en primer lugar puede ser una muy mala idea", dijo Larry Gorenflo, profesor de arquitectura del paisaje, geografía y estudios africanos. , Penn State. "Los seres humanos somos parte de los ecosistemas y espero que este estudio marque el comienzo de un esfuerzo más comprometido para involucrar a los pueblos indígenas en la conservación de localidades que contienen biodiversidad clave".

Gorenflo, en colaboración con la lingüista Suzanne Romaine, Merton College, Universidad de Oxford, Reino Unido, examinó 48 localidades de África designadas por la Organización de las Naciones Unidas para la Educación, la Ciencia y la Cultura (UNESCO) como Sitios del Patrimonio Mundial Natural. Estos sitios albergan "recursos naturales y culturales combinados o naturales de importancia mundial", informan. Este artículo se colocó en línea como manuscrito sin editar en enero de 2021 antes de la publicación final en línea en abril de 2021 en Biología de la Conservación.

Analizaron los datos del sistema de información geográfica sobre idiomas indígenas en estas áreas y encontraron que 147 idiomas se superponían con los sitios de la UNESCO. Las lenguas indígenas se produjeron en todos los sitios del Patrimonio Mundial Natural examinados, excepto en uno.

"El desierto del Mar de Arena de Namib en Namibia es una zona bastante seca", dijo Gorenflo. "Algo desolado, con maravillosas dunas de arena y características naturales, pero tan dura que no hay nadie viviendo allí que yo sepa".

Pero en todos los demás Sitios del Patrimonio Mundial Natural en África continental y en las islas cercanas, los pueblos indígenas no solo viven, sino que, hasta cierto punto, gestionan el medio ambiente en el que viven y lo han estado haciendo durante mucho tiempo.

Niño Masai de pie en un campo con un palo en el Área de Conservación de Ngorongoro, Tanzania. Crédito: Larry Gorenflo, Penn State

"El gran mensaje es básicamente que existe una creciente evidencia de que la diversidad cultural y la biodiversidad están interrelacionadas, y lo encontramos a una escala geográfica bastante fina", dijo Gorenflo. "Si este es el caso, entonces es un argumento sólido para que los pueblos indígenas sean parte de la gestión del ecosistema en los sitios donde viven.

"En términos de enfoque de gestión, cuando hay más de un grupo lingüístico asociado con un sitio específico, la estrategia probablemente debería ser dejar que las personas asociadas con áreas individuales se ocupen de esas áreas", dijo.

Además de encontrar que los hablantes de idiomas indígenas a menudo viven en sitios de alto perfil de la UNESCO, los investigadores también encontraron que el número de idiomas en estas localidades se correlaciona con el número de especies cuyos rangos de ocurrencia incluyen estos sitios.

Para sus datos de idiomas, el equipo utilizó Ethnologue, una base de datos lingüística establecida originalmente para traducir la Biblia y el único conjunto de datos global para idiomas con información geográfica detallada.

"La base de datos ciertamente no es totalmente correcta", dijo Gorenflo. "Pero muestra patrones importantes".

Para los datos de las especies, los investigadores utilizaron la Lista Roja de Especies en Peligro de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza, que incluye datos del rango de especies. Observaron anfibios, mamíferos, reptiles y una colección de especies de agua dulce. También utilizaron datos de Birdlife International y el "Manual de las aves del mundo" para las especies de aves.

Una pequeña manada de cebras en el Área de Conservación de Ngorongoro, Tanzania. Crédito: Larry Gorenflo, Penn State

"Lo que encontramos numéricamente es que dentro de los sitios del Patrimonio Mundial de la UNESCO, si grafica los números de idioma contra los números de rango de especies, encuentra que hay una relación positiva", dijo Gorenflo. "Puede ser porque una mayor complejidad natural genera más complejidad cultural, aunque no lo sabemos con certeza".

Los resultados del estudio revelaron que en los orzuelos de la UNESCO en África, las lenguas indígenas se superponen con los rangos de más de 8.200 especies en los grupos considerados.

Gorenflo sugiere que podría haber una reducción en la biodiversidad en estos sitios africanos de importancia mundial si los grupos indígenas son desplazados o de alguna manera tienen su influencia en la gestión de estas localidades marginadas.

"Nuestro objetivo final es tratar de buscar en algunos lugares y descubrir cómo podríamos rediseñar y reconsiderar las estrategias de gestión y lograr que los pueblos indígenas se involucren más en la gobernanza compartida".

Centrarse en estos sitios de alto perfil de la UNESCO proporciona una base para involucrar a los pueblos indígenas en la gobernanza que, con suerte, se extenderá a lugares menos notables en África y más allá, según Gorenflo.

Espera examinar áreas específicas para aumentar su comprensión de la relación entre la diversidad biológica y lingüística, enfocándose primero en las Montañas del Arco Oriental de Tanzania, donde gran parte de la diversidad lingüística y biológica ocurre en esta nación. También planea examinar Vanuatu, un archipiélago en el hotspot de biodiversidad de las islas Melanesias del este con una diversidad lingüística particularmente densa. Otros dos puntos críticos de biodiversidad de interés son Indo-Birmania (Camboya, Lao, Vietnam, Myanmar y el sur de China) y Mesoamérica, dos regiones donde la diversidad lingüística también es bastante alta.


Diversidad aviar: especiación, macroevolución y función ecológica

El origen, distribución y función de la diversidad biológica son temas fundamentales de la ecología y la biología evolutiva. La investigación sobre aves ha jugado un papel importante en la historia y el desarrollo de estas ideas, sin embargo, el progreso estuvo limitado durante muchas décadas por un enfoque en los patrones de diversidad actual, a menudo restringidos a clados o regiones particulares. Ahora está surgiendo una comprensión más profunda de una ola reciente de estudios integradores que combinan datos completos de rasgos filogenéticos, ambientales y funcionales a escalas sin precedentes. Revisamos estos avances empíricos y describimos cómo están cambiando nuestra comprensión de los patrones globales de diversidad de aves y los procesos por los que surge, con implicaciones para la biogeografía aviar y la ecología funcional. Una mayor expansión e integración de conjuntos de datos puede ayudar a resolver debates de larga data sobre los orígenes evolutivos de la biodiversidad y ofrecer un marco para comprender y predecir la respuesta de los ecosistemas al cambio ambiental.


Métodos

Reclutamiento de pacientes

Reclutamos prospectiva y consecutivamente muestras de tejido de cáncer de mama primario y muestras de sangre emparejadas de pacientes que visitaron dos instituciones (Yonsei Cancer Center y Asan Medical Center, Corea) desde abril de 2013 hasta febrero de 2019. Además, también buscamos en la base de datos de cáncer de mama metastásico en Centro de cáncer de Yonsei (norte = 2548). Los criterios para los respondedores extremos fueron (1) una respuesta completa o (2) una respuesta parcial de más de dos veces la supervivencia libre de progresión (SLP) informada para el cáncer de mama metastásico en los datos históricos. Los criterios para los no respondedores fueron (1) sin reducción en el diámetro del tumor y (2) enfermedad progresiva como la mejor respuesta. Se recopiló información clínica, incluida la edad, el sexo, la duración del tratamiento, la mejor respuesta al tratamiento, el cambio porcentual en el tamaño del tumor, el historial de tratamiento previo y los datos de supervivencia. La evaluación de la respuesta tumoral se realizó según los Criterios de evaluación de la respuesta en tumores sólidos (RECIST), versión 1.1 32. El protocolo del estudio fue aprobado por el comité de ética independiente y la junta de revisión institucional del Hospital Severance y se llevó a cabo de acuerdo con la Declaración de Helsinki y Buenas Prácticas Clínicas. Todos los pacientes dieron su consentimiento informado por escrito para las pruebas genómicas en este estudio. Las muestras fueron evaluadas por un patólogo certificado por la junta (J.S.K.) para identificar áreas con tumores para la extracción de ADN.

Análisis de variantes del genoma

Secuenciación y preprocesamiento del exoma completo

Se aisló ADN genómico de muestras incluidas en parafina fijadas con formalina (FFPE) utilizando los kits de tejido QIAamp DNA FFPE (Qiagen). Se utilizó ADN genómico para la generación de la biblioteca de enriquecimiento de destino SureSelectXT (Agilent) y luego fue capturado por Human All Exon V5 (Agilent). Realizamos un análisis de secuenciación del exoma completo utilizando Illumina HiSeq2500. Para mejorar la calidad de las llamadas de variantes, seguimos las mejores prácticas del kit de herramientas de análisis del genoma (GATK) de preprocesamiento de datos para el descubrimiento de variantes 33. Las lecturas de secuenciación para muestras normales y tumorales se alinearon y procesaron con el genoma de referencia humano (UCSC hg19) utilizando BWA-MEM v0.7.17 y herramientas Picard v2.19.0 (http://broadinstitute.github.io/picard/) 34.

Variantes de un solo nucleótido (SNV) y llamadas indel

Mutect2 en GATK v4.1.0.0 identificaron SNV e indels somáticos en muestras apareadas de tumores normales, con la opción de puntuación de calidad mínima base establecida en 30 35. Los SNV se anotaron y filtraron con SnpEff y SnpSift v4.1 basados ​​en dbSNP v151 36,37,38. Además, anotamos mutaciones somáticas comunes en la base de datos Catalog of Somatic Mutation in Cancer (COSMIC) v86 39. Para minimizar la llamada de SNV falsos positivos resultantes de artefactos, como la contaminación FFPE, utilizamos los módulos de GetPileupSummaries, CalculateContamination, CollectSequencingArtifactMetrics y FilterByOrientationBias incluidos en el filtrado de variantes de GATK.

Para retener solo variantes de codificación no sinónimas de alta confianza, aplicamos los siguientes criterios para una filtración adicional del conjunto de llamadas inicial: (1) variantes rechazadas por el filtro Mutect2, (2) variantes incluidas en regiones no codificantes, (3) variantes con alelos alternativos cuenta & lt3, (4) variantes con una frecuencia alélica & lt0.1, y (5) variantes con un recuento total de alelos (profundidad de lectura) & lt20.

Copiar variantes de número (CNV) llamando

Las CNV se llamaron usando EXCAVATOR2 v1.1.2, con la opción de calidad de mapeo mínima & gt30 40. Se utilizó un modo emparejado para comparar las NVC en muestras de tumores con controles emparejados. Las regiones genómicas con una fracción de número de copias estimada & gt3 entre el tumor y el tejido de control se consideraron como duplicaciones. De manera similar, las regiones con fracciones & lt1 se denominaron deleciones. Consideramos que un gen se ve afectado por CNV si toda la región exónica del gen estaba completamente contenida en las llamadas CNV. Se eliminaron los genes con baja cobertura (profundidad de lectura promedio & lt 20) para reducir la falsa positividad. Todo el proceso de análisis de variantes genómicas se resume en la Fig.1 complementaria.

Análisis de carga mutacional y especificidad de grupo

Se utilizó la prueba de suma de rangos de Wilcoxon de una cola para probar si la carga mutacional (mutaciones somáticas no sinónimas y NVC) difería entre los grupos que respondieron y los que no respondieron. Para probar el enriquecimiento específico del grupo de variantes genómicas, se realizó la prueba exacta de Fisher para cada variante llamada (mutaciones no sinónimas, indels y CNV), aplicando un valor de corte PAG valor de 0,05. En la Fig. 5 complementaria, indicamos genes con NVC específicos de grupo seleccionados por la prueba exacta de Fisher en cada grupo y genes con NVC que reaparecen en ambos grupos. El impacto de la función de los SNV somáticos se predijo utilizando PROVEAN v1.1.5 o SIFT v6.2.1 41,42. Todos los análisis estadísticos se realizaron utilizando la versión 3.6 de R (http://www.r-project.org) con las funciones wilcox.test y fisher.test.

Análisis de la vía de enriquecimiento y firma de mutaciones

La contribución relativa de las firmas mutacionales COSMIC v3 se evaluó entre nuestros respondedores y no respondedores utilizando Mutalisk con firmas específicas de cáncer de mama basadas en la firma PCAWG. Y realizamos una validación cruzada utilizando SigProfiler 43. Se creó una matriz que contiene la información sobre las variantes de mutación somática utilizando el módulo de SigProfilerMatrixGenerator con la opción exome y luego se utilizó para la extracción y visualización de firmas a través de SigProfilerExtractor y SigProfilerPlotting. Para continuar con el análisis de enriquecimiento, seleccionamos genes que estaban mutados en más de dos pacientes dentro de cada grupo. La lista de genes seleccionados en cada grupo se utilizó como datos de entrada para analizar las vías de señalización mutadas en Enrchr 44.

Inferencia de poblaciones clonales e impureza

Las poblaciones clonales de cada paciente con respecto a las CNV y los recuentos alélicos se infirieron utilizando el PyClone con el modelo de emisión Beta Binomial 45. PyClone se realizó utilizando densidades de emisión binomiales y la opción anterior del número total de copias para una mayor confianza de las poblaciones clonales. Los límites sugeridos de cada característica se determinaron utilizando impurezas para distinguir a los respondedores extremos de los no respondedores. La medida de impureza del índice de Gini es uno de los criterios de división del árbol de decisión en la Clasificación. Cuanto menor sea el índice de Gini, mejor será la clasificación, y el índice de Gini se utilizó como valor de corte para distinguir los dos grupos. El índice de Gini se utilizó para medir la impureza de la carga mutacional, la carga del número de copias y los clones de la siguiente manera: (< mathrm> = 1 - mathop < sum> nolimits_^ n <>>>> ^ 2> ), donde PAGci es la probabilidad de la clase Ci 46.

Resumen de informes

Más información sobre el diseño de la investigación está disponible en el Resumen de informes de investigación de la naturaleza vinculado a este artículo.


El material complementario electrónico está disponible en línea en https://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.c.4205108.

Publicado por la Royal Society. Reservados todos los derechos.

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Información del autor

Present address: Perlmutter Cancer Center, New York University Langone Medical Center, New York, NY, USA

Afiliaciones

National Cancer Institute RAS Initiative, Cancer Research Technology Program, Frederick National Laboratory for Cancer Research, Frederick, MD, USA

Suman Mukhopadhyay & Frank McCormick

Koch Institute for Integrative Cancer Research and Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA

Dana–Farber Cancer Institute, Boston, MA, USA

Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, University of California, San Francisco, San Francisco, CA, USA

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Contribuciones

All authors conceived of the article, performed literature searches, integrated the information and wrote, discussed and edited the manuscript.

Autor correspondiente


Influence of landscape context on the abundance and diversity of bees in Mediterranean olive groves

The diversity and abundance of wild bees ensures the delivery of pollination services and the maintenance of ecosystem diversity. As previous studies carried out in Central Europe and the US have shown, bee diversity and abundance is influenced by the structure and the composition of the surrounding landscape. Comparable studies have so far not been carried out in the Mediterranean region. The present study examines the influence of Mediterranean landscape context on the diversity and abundance of wild bees. To do this, we sampled bees in 13 sites in olive groves on Lesvos Island, Greece. Bees were assigned to five categories consisting of three body size groups (small, medium and large bees), the single most abundant bee species ( Lasioglossum marginatum ) and all species combined. The influence of the landscape context on bee abundance and species richness was assessed at five radii (250, 500, 750, 1000 and 1250 m) from the centre of each site. We found that the abundance within bee groups was influenced differently by different landscape parameters and land covers, whereas species richness was unaffected. Generally, smaller bees’ abundance was impacted by landscape parameters at smaller scales and larger bees at larger scales. The land cover that influenced bee abundance positively was olive grove, while phrygana, conifer forest, broad-leaved forest, cultivated land, rock, urban areas and sea had mostly negative or no impact. We stress the need for a holistic approach, including all land covers, when assessing the effects of landscape context on bee diversity and abundance in the Mediterranean.


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